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#Cultures
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Une autre putréfaction de racine
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Celui-ci est particulièrement dur pour contrôler.
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Il y a un autre agent pathogène de putréfaction de racine dans le voisinage. Il a appelé des euteiches d'Aphanomyces. Il aime des pois, des lentilles et des sols inondés. Et il est dur pour traiter parce que ses spores de repos peuvent survivre dans le sol depuis de nombreuses années. Bien qu'Aphanomyces ait été présent dans Manitoba depuis la fin des années 1970, les chercheurs l'ont identifié tout récemment dans Saskatchewan et Alberta. Maintenant ils sont au travail sur quelques nouvelles stratégies pour le contrôler.
Les euteiches d'Aphanomyces est un oomycete, ou le moule d'eau, qui est un organisme comme un champignon. Il produit une génération dans une saison. « Les oospores sont l'inoculum primaire laissé dans le sol ou tissu de décomposition de centre serveur. Ils sont les structures de repos à parois épaisses et très résistantes. Les rapports dans la littérature indiquent qu'ils peuvent survivre dans le sol de cinq à vers le haut de 20 ans, selon des conditions atmosphériques, » explique Syama Chatterton, un pathologiste d'usine avec l'agriculture et le Canada agro-alimentaire (AAFC) dans Lethbridge, Alta.
« Une usine de centre serveur susceptible décharge des exsudats et des signaux de racine dans le sol. Oospores répondent à ces signaux et germent. Par un procédé compliqué de germination, ils produisent par la suite les zoospores, qui sont des cellules avec deux flagelles qui les aident pour nager. » Ils nagent en films de l'eau de sol à la racine de centre serveur et s'attachent à elle.
« Alors ils produisent des hyphae, les brins fongiques qui pénètrent dans la racine, et commencer très rapidement à la coloniser. » Ils décomposent les tissus de racine, alimentant sur les éléments nutritifs. Une fois qu'ils ont épuisé tous les éléments nutritifs dans la racine, ils forment des oospores.
Le cycle de vie entière peut être accompli en environ trois semaines si les états de la température et d'humidité sont idéaux. L'infection peut se produire à n'importe quelle étape du développement du centre serveur, avec la synchronisation selon les conditions environnementales.
Les conditions détrempées et chaudes sont idéales pour l'infection. « Aphanomyces se produit souvent dans un complexe avec d'autres agents pathogènes de putréfaction de racine, comme Fusarium, pythium et Rhizoctonia. Ils tous aiment des conditions moites, mais les oomycetes – pythium et Aphanomyces – améliorent même avec l'humidité excédentaire, » dit Faye Bouchard, spécialiste provincial en maladie végétale avec le ministère de Saskatchewan de l'agriculture. Sur les prairies, les températures optimales de sol pour l'infection d'Aphanomyces (22 à 27 C) sont typiquement atteints par environ juillet (voir le tableau 1).
Chatterton a effectué le travail de gamme de centre serveur d'Aphanomyces avec Sabine Banniza à l'université de Saskatchewan. Ils ont constaté que les pois et les lentilles sont tous deux fortement susceptibles, tandis que les haricots secs, les fèves, les pois chiches et le soja tous ont la jolie bonne résistance. La luzerne est quelque peu susceptible, mais quelques cultivars de luzerne sont résistants. En 2015, Chatterton a examiné des cultures de luzerne cultivées sur les champs qui ont eu des pois dans la rotation et a constaté que les racines de luzerne étaient très saines, suggérant qu'Aphanomyces ne soit probablement pas un grand souci pour la luzerne.
Pourquoi maintenant ?
« Aphanomyces a été autour au Canada depuis les années 1930. Mais nous l'avons juste trouvé en Saskatchewan en 2012 en pois, » Bouchard note. « Alors nous avons commencé à faire plus d'enquêtes pour elle, et Alberta a commencé à la rechercher [et l'a trouvée en 2013]. » Ces enquêtes montrent que l'agent pathogène est assez répandu dans les deux provinces.
Tellement pourquoi la putréfaction de racine d'Aphanomyces a-t-elle devient-elle soudainement une question ? « Mon hypothèse descend à trois raisons qui tout sont venus ensemble dans une tempête parfaite, » Chatterton dit.
« La première raison est que nous atteignons le point où la plupart des endroits en Alberta et Saskatchewan ont eu de bon 25 ans cultiver l'histoire des pois ou des lentilles. Ainsi, si les producteurs emploient de bonnes pratiques de rotation avec une culture de pois ou de lentille une fois pendant toutes les quatre à cinq années, puis quelques champs aurait eu une culture de pois ou de lentille six à sept fois, ou plus souvent si elles ont des rotations plus serrées. Si un champ commençait par un niveau bas d'inoculum… la quantité d'inoculum s'accumulerait graduellement chaque fois qu'une culture susceptible de centre serveur a été plantée parce que les oospores peuvent survivre pendant longtemps. Elle prendrait environ six à sept cycles de culture pour atteindre un seuil d'avertissement d'inoculum où elle est plus répandue dans tout le champ et peut endommager évident, » elle explique.
« La deuxième raison est que nous avons eu plusieurs ressorts vraiment humides dans une rangée, et Aphanomyces dépend de avoir saturé des sols afin d'infecter. Ainsi vous obtenez les infections accrues parce que les conditions environnementales sont exactes, et la charge d'inoculum dans les augmentations de sol tout à fait rapidement. »
Et la troisième raison est une question de détection. « Dans des enquêtes précédentes de putréfaction de racine, ils prenaient des morceaux de racines et les plaquaient sur l'agar pour déterminer l'agent causal. Mais habituellement Fusarium envahit Aphanomyces sur la culture, ainsi il peut être vraiment difficile de confirmer Aphanomyces. Je pense que c'était Sabina Banniza qui a décidé en 2012 de faire un essai d'ACP [qui emploie des marqueurs d'ADN spécifiques aux euteiches d'Aphanomyces]. C'était la première fois que nous pouvions confirmer Aphanomyces dans [un échantillon de Saskatchewan]. Pour nos enquêtes d'Alberta en 2013 et en avant, nous avons augmenté à l'utilisation qu'essai d'ACP. Il a certainement amélioré la détection d'Aphanomyces. »
Dans les enquêtes de putréfaction de racine de Chatterton pour 2013, 2014 et 2015, putréfaction de racine ont été trouvés tous les ans dans environ 70 pour cent des champs examinés, mais la sévérité de la maladie a varié considérablement d'année en année. Les niveaux les plus élevés de putréfaction de racine se sont produits en 2014 parce que c'était une année particulièrement humide. Chatterton dit, « en 2014, nous avons constaté que la putréfaction de racine était commune et répandue dans l'ensemble d'Alberta. Les résultats des essais d'ACP ont montré qu'Aphanomyces était présent dans environ 44 pour cent de tous les champs dans Alberta et dans 60 pour cent de champs qui ont eu des symptômes de putréfaction de racine. »
L'analyse d'ACP des échantillons 2015 d'Alberta n'est pas encore complète, mais les enquêtes de champ ont montré que sévérité de putréfaction de racine était certainement inférieure à l'en 2014, en raison des conditions très sèches en 2015.
Les enquêtes d'Alberta prouvent également que « les champs Aphanomyces-positifs sont plus communs dans les zones noires et grises de sol qui sont plus typiques d'Alberta central. Je pense que c'est parce qu'elles ont eu une histoire assez longue de production de pois là, et ces secteurs tendent à être plus humides qu'Alberta du sud, » Chatterton note. « Dans la zone de sol de Brown d'Alberta du sud en 2014, seulement environ 18 pour cent des champs étaient positifs. »
Bien que Saskatchewan n'ait pas fait une enquête formelle de putréfaction de racine en 2015, les conditions sèches au printemps et le début de l'été ont vraisemblablement réduit la quantité de la maladie. Bouchard n'a pas vu autant putréfaction de racine dans le domaine, elle n'a pas obtenu autant d'enquêtes à son sujet des cultivateurs, et moins échantillons ont été soumis au laboratoire de protection des cultures du ministère.
Difficile à diagnostiquer dans le domaine
Essai de figurer que les agents pathogènes de putréfaction de racine vous ont dans votre domaine n'est pas facile. De surface, ils partagent les mêmes symptômes, comme l'émergence pauvre, le fanage, le jaunissement et l'arrêt. Les symptômes souterrains sont habituellement un mélange embrouillant provoqué par un complexe des agents pathogènes.
Dans le laboratoire, si vous infectez des usines avec seulement Aphanomyces, les symptômes sont distinctifs. « Le système entier de racine aura une décoloration de miel-caramel. Et le symptomology classique est que l'epicotyl, qui est la partie entre le point d'attachement de graine et la tige verte, devient très étroitement resserré et a cette même couleur miel-brune, qui arrête abruptement juste à la tige verte, » Chatterton explique. « En outre, parce que la maladie cause le délabrement du cortex entier de racine mais pas du système vasculaire, souvent si vous tirez vers le haut l'usine du sol, seulement le paquet vasculaire blanc est laissé et le reste des racines sont allés. »
Dans le domaine, les espèces de Fusarium tendent à coloniser le tissu qu'Aphanomyces a déjà commencé à infecter, produisant des symptômes mélangés. « Les racines sembleront noires et seront taillées loin ; Fusarium cause l'élagage des racines. Ainsi vous obtenez un désordre laid d'une fondation noire et les racines latérales de décomposition brunes, » Chatterton dit. « Une bonne manière de vérifier Fusarium est qu'elle cause la coloration rouge dans le système vasculaire. »
Quand une infection de putréfaction de racine est avancée, il est particulièrement difficile de figurer la cause originale. « Sont non seulement la décomposition de racines et l'usine mourant, mais il pourrait y avoir des agents pathogènes de putréfaction de racine multiple aussi bien que les saprophytes, qui sont des organismes fongiques qui vivent sur la décomposition et la matière végétale morte, » Bouchard indique.
Elle ajoute, « l'autre difficulté est qu'il est difficile de séparer les dommages qui des causes excédentaires d'humidité à la culture, même sans tous agents pathogènes présents. Les lentilles et particulièrement les pois ne font pas comme les pieds humides, quand l'usine se repose dans trop d'eau. Ces seules conditions signifieront que les racines ne se développeront pas aussi bien et ne formeront pas probablement des nodules en tant que bien, et les pièces d'usine de surface jauniront, arrêteront et se faneront probablement. Mais ces conditions humides soumettent à une contrainte l'usine, ainsi si un agent pathogène est présent, il endommagera probablement bien plus en raison de l'effort. »
La meilleure manière de dire quels agents pathogènes de putréfaction de racine sont présents est d'envoyer des échantillons à un laboratoire diagnostique, tel que le laboratoire de protection des cultures de Saskatchewan, les laboratoires de graine de découverte ou les laboratoires de graine de BioVision.
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Recherche de plus d'options de gestion
Les chercheurs en Alberta et Saskatchewan abordent Aphanomyces de plusieurs angles. Par exemple, à l'université de Saskatchewan, ils travaillent à développer les lignes résistantes des pois et des lentilles.
Pour évaluer de diverses pratiques de gestion d'Aphanomyces en pois fourragers, Chatterton a lancé une grande étude en 2015. L'étude a lieu Drumheller, ruisseaux, Taber, Lethbridge, à Saskatoon, et deux sites dans la région rouge de cerfs communs-Lacombe. Collaborent avec Chatterton Mike Harding et Robyne Bowness à Alberta Agriculture et à la sylviculture, et Bruce Gossen à AAFC à Saskatoon. Alberta Crop Industry Development Fund, Alberta Pulse Growers et les AAFC, par le groupe en avant croissant de 2 impulsions, financent l'étude.
À chaque site, l'étude évalue des traitements de graine, la résistance de cultivar et des amendements de sol. Tous les sites sont dans les domaines des producteurs. Six des sept sites ont été choisis parce que les champs ont eu un à haut risque pour la putréfaction de racine d'Aphanomyces ; le site de Lethbridge a seulement eu la putréfaction de racine de Fusarium.
Les procès de traitement de graine incluent différentes combinaisons de divers produits avec l'activité contre Fusarium, pythium, Rhizoctonia et Aphanomyces. Le traitement de graine pour Aphanomyces est ethaboxam (solo d'Intego) – une nouvelle option qui a été donnée l'enregistrement d'utilisation de secours sur des pois fourragers dans Alberta, Saskatchewan et Manitoba en 2015.
Les procès de cultivar impliquent 20 cultivars de pois, y compris quelques cultivars actuellement populaires aussi bien qu'une partie qui sont sur le point juste d'être libérée.
Les procès d'amendement de sol comparent trois possibilités. « Nous avons recherché la littérature n'importe quel exemple de quelque chose qui pourrait avoir qu'un certain effet contre Aphanomyces, » Chatterton explique. Un traitement emploie le calcium, impliquant la chaux épuisée de l'industrie de betterave à sucre ; le calcium a réduit la production de zoospore dans des essais de serre chaude. Un autre traitement est Phostrol, un produit basé sur phosphite, qui a l'activité contre des oomycetes et si une certaine suppression d'Aphanomyces en pois dans le nord-ouest Pacifique. Le troisième traitement est le bord d'herbicide (ethalfluralin), qui a montré la suppression d'Aphanomyces dans un certain travail préliminaire il y a quelques décennies.
Par la première année de l'étude, tous les cultivars étaient susceptibles de la putréfaction de racine d'Aphanomyces, comme prévu de la serre chaude précédente examinant à l'université de Saskatchewan.
« Les traitements de graine et les amendements de sol ont donné quelques résultats prometteurs au début de la saison. Par environ cinq à six semaines, nous pourrions voir quelques différences visuelles gentilles dans la sévérité de putréfaction de racine entre certains des traitements, » Chatterton dit. « Mais vers la fin de la période de végétation, les putréfactions de racine étaient assez semblables d'un bout de l'affaire à l'autre. Quelques traitements ont certainement rapporté mieux que d'autres, mais nous n'avons trouvé aucune différence statistiquement significative entre les traitements. »
Avec seulement un an de données pendant une année exceptionnellement sèche, il est trop tôt de tirer toutes les conclusions. En outre, Chatterton indique un défi principal avec l'essai de faire ces types d'essais pratiques. « Puisque la distribution [d'Aphanomyces] peut être très inégale dans les domaines, nous avons dû choisir des sites avec des niveaux très élevés des putréfactions de racine d'Aphanomyces. Je pense que la charge d'inoculum à certains de ces sites est trop haute, et à ce niveau, les stratégies de gestion de la maladie souvent ne s'attaquent pas pour fonctionner. Nous pourrions essayer de trouver les sites qui ont un niveau plus bas d'Aphanomyces, mais d'autre part nous ne serons pas certains que l'inoculum ait écarté dans tout le sol [ainsi quelques complots pourrait avoir différents niveaux d'inoculum]. »
Les chercheurs répéteront les procès en 2016. Puis, Chatterton espère obtenir le placement continu pendant plusieurs plus d'années de déterminer combien bas les niveaux d'inoculum doivent être pour que les pratiques soient efficaces.
Dans un projet financé par les cultivateurs d'impulsion de Saskatchewan, Chatterton et Banniza déterminent combien inoculum d'Aphanomyces coûte nécessaire pour causer différents niveaux de la maladie. « En ce moment, vous pouvez soumettre des échantillons à un laboratoire pour découvrir si Aphanomyces est présent ou absent, mais le laboratoire ne peut pas déterminer si vous avez un bas ou à haut risque d'obtenir la putréfaction de racine d'Aphanomyces, » Chatterton dit.
« Ainsi nous voulons déterminer la quantité d'inoculum requise dans le Brown, Brown foncé et zones noires de sol obtenir les niveaux bas, moyens ou élevés de la maladie. L'idée est que les laboratoires d'essais intéressés pourraient alors offrir un service de quantification d'ADN pour Aphanomyces et pouvoir employer les niveaux d'ADN pour déterminer si un champ a un bas, modéré ou le haut niveau d'Aphanomyces. Cela devrait aider à informer des décisions sur la durée des pois ou les lentilles pourraient devoir être hors de la rotation, ou si le cultivateur pourrait regarder des traitements de graine ou peut-être un traitement d'amendement de sol. »
Conseil pour des cultivateurs
Actuellement, la meilleure stratégie est de soumettre des échantillons de plante ou de sol à un laboratoire diagnostique pour déterminer quelles putréfactions de racine posent des problèmes dans vos domaines, et si Aphanomyces est une question, puis employez cette information dans vos décisions de gestion.
Pour les champs qui sont fortement infestés avec Aphanomyces, Bouchard et Chatterton conseillez attendre au moins six ans avant de planter des pois ou des lentilles encore. Bouchard dit, « si tout va bien les cultivateurs ne devront pas faire cela sur une base permanente parce qu'il devrait y avoir plus d'options disponibles comme plus de recherche est faite. Un traitement de graine, appelé le solo d'Intego, est disponible maintenant, et il y a potentiellement d'autres options de traitement descendant la canalisation. Et si tout va bien nous obtiendrons quelques variétés résistantes. »
Dans le même temps, Chatterton propose, « si vous voulez cultiver une culture d'impulsion [sur un champ qui est fortement infesté avec Aphanomyces], alors les fèves sont une option vraiment bonne parce qu'elles sont vraiment résistantes à Aphanomyces. «
Pour des champs avec des infestations faiblees-à-modérées d'Aphanomyces, Chatterton recommande de prolonger des rotations de pois ou de lentille de trois ou quatre ans peut-être aux cinq ou six années. Elle ajoute, « tels sont de bons champs pour probablement utilisant un traitement de graine avec l'activité contre tous les agents pathogènes dans le complexe de putréfaction de racine, et cela devrait aider à amplifier votre culture et à la maintenir plus saine. »